東北、北陸、関東で平年より低い
【気圧配置】
15時では、台風が先島諸島の南に、高気圧が日本海にあり、前線が北陸～関東に停滞している。
【北日本：北海道、東北】
北海道は北西の風で概ね晴れて平年並みの所が多いが、太平洋側東部を中心に風が山越えとなり平年より高め～高い所があった。東北は曇りや雨で平年並み～低い所が多いが、北部の一部では少し日照があり青森の１地点で平年より高めとなった。
【東日本：関東甲信、東海、北陸】
福井を除く北陸と関東は曇りや雨で平年並み～低い所が多いが、その他は概ね晴れて平年並み～高めの所が多くなった。
【西日本：近畿、中国、四国、九州】
概ね晴れて平年並み～高めの所が多いが、島根県隠岐では前線の北側の寒気により１地点で平年より低めとなった。
【沖縄・奄美】
先島諸島では曇りや雨、その他は概ね晴れて、東よりの風が吹き、全地点で平年並みとなった。
※ 図は気象庁HPより転載、表は気象庁HP掲載データを使用して作成
※ 9月3日(日本時間24時まで)の国内気温記録更新：なし
| 2019/9/3 | 21時までの最高気温平年差(小数点以下切り捨て） | |
| 地方 | 平年差の最低～最高 | 平年差の大きい地域 |
| 北海道 | -1 ～ +6 | 釧路+6、根室、十勝+4 |
| 東北 | -6 ～ +3 | 山形、福島-6、秋田、宮城-4、青森+3 |
| 関東甲信 | -5 ～ +4 | 埼玉、長野-5、茨城、群馬-4、 長野+4、伊豆諸島、千葉、山梨+3 |
| 東海 | 0 ～ +3 | 全4県+3 |
| 北陸 | -7 ～ +3 | 新潟-7、富山、石川-5、石川、福井+3 |
| 近畿 | 0 ～ +4 | 滋賀+4、京都、兵庫、奈良+3 |
| 中国 | -3 ～ +3 | 島根-3、岡山、広島、鳥取+3 |
| 四国 | 0 ～ +3 | 徳島、高知+3 |
| 九州 | -1 ～ +3 | 福岡、大分、熊本、宮崎、鹿児島+3 |
| 沖縄・奄美 | 0 ～ +2 | |
| 850hPa気温、平年差 | ||
| 2019/9/3 09時(日本時間) | ||
| 地点 | 観測値 | 平年差 |
| 稚内 | 7.6 | -3.2 |
| 札幌 | 9.4 | -2.7 |
| 釧路 | 11.2 | -0.6 |
| 秋田 | 12.4 | -2.1 |
| 輪島 | 15.0 | -0.5 |
| つくば | 16.8 | +0.2 |
| 八丈島 | 16.8 | -1.2 |
| 松江 | 16.8 | +0.9 |
| 潮岬 | 19.2 | +1.8 |
| 福岡 | 17.0 | 0.0 |
| 鹿児島 | 18.4 | +0.7 |
| 名瀬 | 18.0 | -0.4 |
| 南大東島 | 18.6 | -0.2 |
| 石垣島 | 18.6 | -0.3 |
| 父島 | 20.0 | +1.6 |