北日本への暖気流入持続
【気圧配置】
６時では、日本の東から気圧の尾根が本州付近に張り出し、前線が奄美に停滞している。
【北日本：北海道、東北】
暖気に覆われており平年並み～高い所が多い。平年並みは風が止んで冷え込んだ所、平年より高いのは風の吹続や雲により冷え込みが抑えられた所が多い。東北南部では一部で冷え込んで平年より低めとなった。
【東日本：関東甲信、東海、北陸】
上空の気温は平年並み、概ね晴れたが冷え込みは弱く平年並み～高めの所が多い。長野の標高の高い１地点では冷え込みにより平年より低め。福井の１地点では山越えの風に冷え込みが抑えられて平年より高くなった。
【西日本：近畿、中国、四国、九州】
上空の気温は平年並みだが、次第に雲に覆われて平年並み～高めの所が多い。山口の１地点で平年より高くなったが、普段冷え込むために平年値が低いためと思われる。
【沖縄・奄美】
前線に近い奄美で暖気の影響が大きく平年より高めの地点が多いが、沖縄県は平年並みの所が多く、平年より高めは沖縄本島の１地点のみ。
※ 6月5日の国内気温記録更新：なし
| 2018/6/5 | 8時までの最低気温平年差 | |
| 地方 | 平年差の最低～最高 | 平年差の大きい地域 |
| 北海道 | 0 ～ +12 | 宗谷+12、網走、十勝+7、留萌、石狩+6 |
| 東北 | -4 ～ +7 | 福島-4、青森+7、岩手+5 |
| 関東甲信 | -3 ～ +4 | 長野-3、長野+4、茨城、伊豆諸島、千葉+3 |
| 東海 | -2 ～ +3 | 岐阜+3 |
| 北陸 | 0 ～ +5 | 福井+5、新潟、石川+3 |
| 近畿 | -2 ～ +3 | 滋賀、京都+3 |
| 中国 | 0 ～ +6 | 山口+6、島根、鳥取+3 |
| 四国 | -1 ～ +2 | |
| 九州 | 0 ～ +3 | 全7県+3 |
| 沖縄・奄美 | 0 ～ +3 | 奄美、沖縄本島+3 |
| 850hPa気温、平年差 | ||
| 2018/6/4 21時(日本時間) | ||
| 地点 | 観測値 | 平年差 |
| 稚内 | 19.0 | +11.4 |
| 札幌 | 17.6 | +9.3 |
| 釧路 | 18.0 | +10.6 |
| 秋田 | 16.6 | +6.4 |
| 輪島 | 14.0 | +2.0 |
| つくば | 12.8 | +0.7 |
| 八丈島 | 13.8 | 0.0 |
| 松江 | 13.6 | +0.6 |
| 潮岬 | 15.0 | +1.6 |
| 福岡 | 13.8 | -0.2 |
| 鹿児島 | 13.0 | -1.3 |
| 名瀬 | 17.6 | +1.4 |
| 南大東島 | 18.6 | +1.1 |
| 石垣島 | 19.6 | +1.3 |
| 父島 | 17.2 | +0.3 |