全国的に平年並み～高めの所が多い
【気圧配置】
15時では、高気圧が日本の南にあり、寒冷前線が北海道にかかっている。
【北日本：北海道、東北】
北海道は暖気流入により平年並み～高く、平年より高いのは山越えの風となった所が中心。東北は晴れや曇りで平年並み～高めの所が多いが、岩手では内陸部中心に風が弱く気温が上がり、平年より高くなった所があった。
【東日本：関東甲信、東海、北陸】
晴れや曇りで平年並み～高めの所が多いが、千葉、静岡では雲が多く平年より低めの所があった。平年より高めは日照の多かった内陸部が中心。
【西日本：近畿、中国、四国、九州】
晴れや曇りで平年並み～高めの所が多いが、大分の１地点では晴れて風が弱く、平年より高くなった。
【沖縄・奄美】
先島諸島と沖縄本島の一部は風が吹き続けて平年並み、その他は晴れて風も弱いが平年並みの所が多く、沖縄本島の１地点のみ平年より高めとなった。
※ 9月16日の国内気温記録更新：なし
| 2018/9/16 | 20時までの最高気温平年差(小数点以下切り捨て） | |
| 地方 | 平年差の最低～最高 | 平年差の大きい地域 |
| 北海道 | 0 ～ +6 | 網走+6、上川、根室+5 |
| 東北 | 0 ～ +6 | 岩手+6、青森、秋田、宮城、山形+4 |
| 関東甲信 | -3 ～ +4 | 千葉-3、長野+4、栃木、群馬、山梨+3 |
| 東海 | -3 ～ +3 | 静岡-3、三重+3 |
| 北陸 | -2 ～ +3 | 富山+3 |
| 近畿 | 0 ～ +4 | 兵庫、和歌山+4、京都、奈良+3 |
| 中国 | 0 ～ +3 | 全5県+3 |
| 四国 | 0 ～ +4 | 香川、愛媛、高知+4、徳島+3 |
| 九州 | 0 ～ +5 | 大分+5、宮崎、鹿児島+4 |
| 沖縄・奄美 | 0 ～ +3 | 沖縄本島+3 |
| 850hPa気温、平年差 | ||
| 2018/9/16 09時(日本時間) | ||
| 地点 | 観測値 | 平年差 |
| 稚内 | 10.8 | +3.0 |
| 札幌 | 13.8 | +4.5 |
| 釧路 | 13.2 | +4.1 |
| 秋田 | 12.6 | +0.4 |
| 輪島 | 14.4 | +0.9 |
| つくば | 16.2 | +1.4 |
| 八丈島 | 17.0 | +0.1 |
| 松江 | 15.8 | +1.9 |
| 潮岬 | 17.4 | +1.2 |
| 福岡 | 18.8 | +3.6 |
| 鹿児島 | 18.2 | +1.6 |
| 名瀬 | 19.0 | +1.5 |
| 南大東島 | 18.4 | +0.2 |
| 石垣島 | 18.8 | +0.7 |
| 父島 | 18.2 | 0.0 |