東日本太平洋側中心に平年より低い
【気圧配置】
15時では、高気圧が北海道にあり、前線が関東南岸～紀伊半島～中国に停滞、前線上の房総半島付近と対馬海峡に低気圧がある。
【北日本：北海道、東北】
北海道は概ね晴れて平年並み～高めとなった。東北は、北部は晴れから曇って平年並みの所が多く、南部は曇りや雨で平年並み～低く、特に福島は雨が降り続いて平年より低い地点が多くなった。
【東日本：関東甲信、東海、北陸】
太平洋側は雨で平年より低め～低い所が多い。日本海側は曇りや雨で平年並みの所が多い。
【西日本：近畿、中国、四国、九州】
曇りや雨で平年並み～低めの所が多いが、日本海側と四国では少し日照が出て所々で平年より高めとなった。
【沖縄・奄美】
晴れや曇りで風は強くなく、平年差は全地点でプラスとなったが、＋３℃以上（平年より高め）の地点は無かった。
※ 9月21日の国内気温記録更新：なし
| 2018/9/21 | 22時までの最高気温平年差(小数点以下切り捨て） | |
| 地方 | 平年差の最低～最高 | 平年差の大きい地域 |
| 北海道 | 0 ～ +4 | 石狩、空知+4 |
| 東北 | -6 ～ +3 | 福島-6、宮城-5、秋田+3 |
| 関東甲信 | -8 ～ +2 | 長野-8、茨城、群馬、埼玉、山梨-7 |
| 東海 | -8 ～ 0 | 静岡-8、愛知-7 |
| 北陸 | -3 ～ +1 | 新潟-3 |
| 近畿 | -4 ～ +4 | 滋賀-4、京都、兵庫、奈良-3、兵庫+4、京都+3 |
| 中国 | -4 ～ +3 | 岡山、広島-4、島根、鳥取+3 |
| 四国 | -2 ～ +3 | 徳島、愛媛+3 |
| 九州 | -3 ～ +3 | 熊本、宮崎、鹿児島-3、福岡+3 |
| 沖縄・奄美 | 0 ～ +2 | |
| 850hPa気温、平年差 | ||
| 2018/9/21 09時(日本時間) | ||
| 地点 | 観測値 | 平年差 |
| 稚内 | 5.2 | -1.1 |
| 札幌 | 7.4 | -0.6 |
| 釧路 | 6.6 | -1.2 |
| 秋田 | 11.4 | +0.5 |
| 輪島 | 12.8 | +0.5 |
| つくば | 12.6 | -1.0 |
| 八丈島 | 16.6 | +0.5 |
| 松江 | 15.8 | +2.9 |
| 潮岬 | 17.2 | +2.0 |
| 福岡 | 17.2 | +3.1 |
| 鹿児島 | 17.6 | +1.9 |
| 名瀬 | 19.0 | +2.2 |
| 南大東島 | 19.0 | +1.3 |
| 石垣島 | 18.2 | +0.6 |
| 父島 | 18.4 | +0.5 |