雨の降った伊豆諸島南部と沖縄・奄美で平年より低め
【気圧配置】
15時では、台風が沖縄の南、低気圧がオホーツク海、高気圧が黄海と日本の東にあり、前線が伊豆諸島南部から奄美の南に停滞している。
【北日本：北海道、東北】
北海道は西よりの風で昼にかけて晴れた所が多く平年並み～高めで、網走と十勝の計３地点では平年より高くなった。東北は概ね晴れて平年並み～高めとなった。
【東日本：関東甲信、東海、北陸】
日本海側は晴れたが海からの風で全地点で平年並みとなった。太平洋側は晴れて平年並み～高めだが、関東南部や伊豆諸島は雲に覆われて平年並みの所が多く伊豆諸島南部では雨で平年より低めとなった。
【西日本：近畿、中国、四国、九州】
上空の寒気は抜けつつあり、概ね晴れて平年並みの所がほとんどだが、滋賀の１地点でよく晴れて平年より高め、鹿児島県種子島・屋久島では雲に覆われて２地点で平年より低めとなった。
【沖縄・奄美】
上空の寒気は抜けたが、曇りや雨で平年並み～低めとなった。
※ 10月3日の国内気温記録更新：なし
| 2018/10/3 | 20時までの最高気温平年差(小数点以下切り捨て） | |
| 地方 | 平年差の最低～最高 | 平年差の大きい地域 |
| 北海道 | 0 ～ +5 | 網走、十勝+5、根室、釧路+4 |
| 東北 | 0 ～ +3 | 青森、岩手、宮城、福島+3 |
| 関東甲信 | -3 ～ +4 | 伊豆諸島-3、群馬+4、茨城、栃木、埼玉、長野+3 |
| 東海 | -1 ～ +4 | 岐阜+4 |
| 北陸 | -1 ～ +1 | |
| 近畿 | 0 ～ +3 | 滋賀+3 |
| 中国 | -1 ～ +2 | |
| 四国 | -1 ～ +2 | |
| 九州 | -3 ～ +1 | 鹿児島-3 |
| 沖縄・奄美 | -4 ～ 0 | 奄美、沖縄本島-4、先島諸島-3 |
| 850hPa気温、平年差 | ||
| 2018/10/3 09時(日本時間) | ||
| 地点 | 観測値 | 平年差 |
| 稚内 | 6.2 | +2.2 |
| 札幌 | 7.4 | +1.9 |
| 釧路 | 5.4 | -0.1 |
| 秋田 | 5.2 | -3.0 |
| 輪島 | 7.4 | -2.3 |
| つくば | 12.8 | +1.6 |
| 八丈島 | 15.4 | +0.8 |
| 松江 | 8.6 | -1.9 |
| 潮岬 | 14.8 | +1.4 |
| 福岡 | 12.0 | 0.0 |
| 鹿児島 | 11.0 | -3.2 |
| 名瀬 | 14.6 | -1.0 |
| 南大東島 | 18.8 | +1.7 |
| 石垣島 | 15.2 | -1.7 |
| 父島 | 18.8 | +1.2 |