北海道、東日本太平洋側で平年より高め～高い地点多い
【気圧配置】
６時では、低気圧がハバロフスク付近と関東の東にあり、前線が九州の南～小笠原諸島の北に停滞している。
【北日本：北海道、東北】
北海道は概ね曇りで平年並み～高く、平年より高いのは南よりの風が山を越えて吹いた所が中心。東北は曇りや雨から次第に晴れて平年並み～高めの所が多く宮城の１地点では平年より高いが、日本海側や内陸部では冷え込んで平年並みの所が多い。
【東日本：関東甲信、東海、北陸】
日本海側は曇りから次第に晴れて平年並み～高め。太平洋側も曇りから次第に晴れたが雲のかかった時間が長く平年並み～高くなった。
【西日本：近畿、中国、四国、九州】
近畿、中国、四国は概ね晴れて平年並みの所が多く、所々で平年より高め。九州は曇りや晴れで平年並み～高めの所が多く、長崎の１地点では平年より高くなった。
【沖縄・奄美】
南西～南の風で平年並み～高めとなった。
※ 図は気象庁HPより転載、表は気象庁HP掲載データを使用して作成
※ 6月3日(日本時間24時まで)の国内気温記録更新：なし
| 2020/6/3 | 8時までの最低気温平年差(小数点以下切り捨て） | |
| 地方 | 平年差の最低～最高 | 平年差の大きい地域 |
| 北海道 | 0 ～ +7 | 留萌+7、宗谷、後志+6、空知、網走、釧路、十勝+5 |
| 東北 | -1 ～ +5 | 宮城+5、岩手、福島+4 |
| 関東甲信 | 0 ～ +6 | 伊豆諸島+6、埼玉、東京、千葉、山梨+5 |
| 東海 | 0 ～ +6 | 静岡+6、三重+5 |
| 北陸 | 0 ～ +3 | 福井除く3県+3 |
| 近畿 | 0 ～ +3 | 滋賀、大阪、奈良+3 |
| 中国 | -1 ～ +3 | 島根+3 |
| 四国 | -2 ～ +3 | 高知+3 |
| 九州 | -1 ～ +5 | 長崎+5、佐賀+4 |
| 沖縄・奄美 | +1 ～ +4 | 奄美、先島諸島+4、沖縄本島+3 |
| 地点 | 観測値 | 平年差 | 稚内 | 7.2 | 0.0 |
|---|---|---|
| 札幌 | 7.0 | -0.9 |
| 釧路(根室) | 10.8 | +3.7 |
| 秋田 | 10.2 | +0.4 |
| 輪島 | 12.6 | +1.0 |
| つくば | 14.4 | +2.6 |
| 八丈島 | 16.2 | +2.7 |
| 松江(米子) | 13.8 | +1.1 |
| 潮岬 | 17.4 | +4.2 |
| 福岡 | 17.0 | +3.3 |
| 鹿児島 | 17.8 | +3.7 |
| 名瀬 | 18.4 | +2.4 |
| 南大東島 | 18.2 | +0.9 |
| 石垣島 | 20.2 | +2.0 |
| 父島 | 19.2 | +2.5 |