北日本日本海側と新潟で平年より高め～高い地点多い
【気圧配置】
15時では、低気圧が中国北東部、チェジュ島付近と小笠原諸島の北西に、高気圧が日本の東と千島列島の東にある。
【北日本：北海道、東北】
北海道は晴れ後曇りで平年並み～高い所が多いが、平年より高いのは南東の風が山越えとなった日本海側が中心で、釧路と渡島の各１地点では海からの風が吹いて日照が無く平年より低めとなった。東北は晴れで夕方以降次第に曇り、平年並み～高いが、平年より高いのは南東の風が山越えとなった日本海側が中心。
【東日本：関東甲信、東海、北陸】
太平洋側は曇りや晴れで夕方からは次第に全域で曇り、平年並みの所が多いが、長野北部の１地点では平年より高めとなった。日本海側は晴れ後曇りで平年並み～高めの所が多いが、新潟では南東の山越えの風の影響や日照も多かったため11地点で平年より高く、福井の１地点でも平年より高くなった。
【西日本：近畿、中国、四国、九州】
近畿は晴れ後曇りで平年並みの所が多いが、日本海側沿岸部では南よりの山越えの風により計３地点で平年より高め～高くなった。中国、四国は曇り後雨で平年並み～低めの所が多く、山口、徳島の各１地点では平年より低いが、島根、鳥取の沿岸部の計６地点では南よりの山越えの風により平年より高めとなった。九州は概ね雨で平年並み～低くなった。
【沖縄・奄美】
南よりの風が吹き曇りや晴れで所々で雨、平年並み～高めとなったが、大東島では全地点で平年並み。
※ 図は気象庁HP、日本気象協会HPより転載、表は気象庁HP掲載データを使用して作成
※ 6月3日(日本時間24時まで)の国内気温記録更新：なし
| 2021/6/3 | 18時までの最高気温平年差(小数点以下切り捨て） | |
| 地方 | 平年差の最低～最高 | 平年差の大きい地域 |
| 北海道 | -4 ～ +8 | 渡島-4、釧路-3、檜山+8、留萌、石狩、後志+7 |
| 東北 | -1 ～ +8 | 秋田、山形+8、青森、岩手+6 |
| 関東甲信 | -2 ～ +3 | 長野+3 |
| 東海 | -1 ～ +2 | |
| 北陸 | 0 ～ +6 | 新潟+6、福井+5 |
| 近畿 | -2 ～ +5 | 兵庫+5、京都+4 |
| 中国 | -6 ～ +4 | 山口-6、広島-4、鳥取+4、島根+3 |
| 四国 | -5 ～ +1 | 徳島-5、愛媛、高知-4 |
| 九州 | -6 ～ 0 | 熊本-6、福岡、佐賀、宮崎、鹿児島-5 |
| 沖縄・奄美 | 0 ～ +4 | 奄美、沖縄本島+4、先島諸島+3 |
| 地点 | 観測値 | 平年差 | 稚内 | 9.4 | +1.8 |
|---|---|---|
| 札幌 | 10.0 | +1.6 |
| 釧路 | 8.2 | -0.4 |
| 秋田 | 13.6 | +4.0 |
| 輪島 | 12.8 | +1.6 |
| つくば | 10.8 | -0.6 |
| 八丈島 | 14.2 | +1.1 |
| 松江 | 13.8 | +1.2 |
| 潮岬 | 10.6 | -2.3 |
| 福岡 | 15.0 | +1.7 |
| 鹿児島 | 15.2 | +1.0 |
| 名瀬 | 17.6 | +1.6 |
| 南大東島 | 20.0 | +2.6 |
| 石垣島 | 20.2 | +1.8 |
| 父島 | 17.4 | +0.7 |